Identifiquen alteracions inductores del desenvolupament de càncer gràcies a una innovadora tècnica que combina screening computacional i en organoides

Els resultats de l'estudi que s'ha publicat a la revista Cell Report validen l'ús d'aquesta tècnica innovadora i confirmen la identificació de dos nous drivers al càncer d'esòfag i al càncer de la cavitat oral.

05/12/2023

Un estudi internacional en què han col·laborat la Universitat de Stanford, la Universitat d'Illinois i el Vall d'Hebron Institut d'Oncologia (VHIO), que forma part del Campus Vall d’Hebron, valida una nova metodologia per identificar variacions genètiques inductores de càncer, cosa que coneixem com a drivers, a través de l'anàlisi de l’augment de còpies genètiques en models preclínics organoides. L'estudi ha estat publicat a la revista Cell Reports.

Les cèl·lules tumorals requereixen una o diverses alteracions en el seu ADN que provoquen la seva divisió i proliferació incontrolada, anomenades drivers. Alguns d'aquests drivers consisteixen en un increment en certes regions del genoma del nombre de còpies d'ADN. No obstant això, aquestes regions poden ser molt àmplies i, en molts casos, no es coneix quin és el gen que actua com a driver dins d'aquesta regió.

Aquest treball compta amb una aproximació computacional liderada pel laboratori de la Dra. Christina Curtis de la Universitat de Stanford i el Grup de Biologia Computacional del VHIO, liderat pel Dr. José Antonio Seoane i un screening en organoides desenvolupat pel laboratori del Dr. – Calvin Kuo, de la Universitat de Stanford.

L'objectiu d'aquest treball era identificar alteracions noves del nombre de còpies inductores del desenvolupament del càncer. “En primer lloc,” explica el Dr. José Antonio Seoane, cap del grup de Biologia Computacional del Càncer i co-primer autor de l'estudi juntament amb el Dr. Ameen Salahudeen de la Universitat d'Illinois a Chicago, “fem un screening computacional amb la idea d'identificar les amplificacions en el nombre de còpies que podien estar relacionades amb l'oncogènesi, analitzant la freqüència d'aparició d'aquestes alteracions a les dades del Projecte de l'Atlas del Genoma Humà (TCGA) i correlacionant-les amb canvis a l'expressió dels gens”.

Aquesta aproximació computacional integrativa va permetre reduir el nombre de gens candidats a ser drivers oncogènics a uns 1.000. D’entre aquests un subconjunt de 393 gens candidats es van validar en organoides (models tridimensionals d'òrgans creats al laboratori) de ratolí i humans de càncer d'esòfag, cavitat oral, còlon, estómac, pàncrees i pulmó. Els investigadors van provocar amplificacions del nombre de còpies marcades amb un codi de barres mitjançant la infecció de cADN per lentivirus. Posteriorment, van deixar créixer els organoides i es van seqüenciar per quantificar les poblacions de gens marcats, a més clons més probabilitats que aquest gen sigui efectivament un driver.

"Utilitzant aquest sistema de codis de barres i lentivirus vam poder identificar diversos oncogens ja coneguts com a CDK4 i CDK6 o KRAS en aquests tipus de càncer validant la nova metodologia" explica el Dr. Seoane "però, a més, hem estat capaços d'identificar dos nous drivers oncogènics FGF3 en càncer d'esòfag i DYRK2 en càncer de la cavitat oral”.

“L'article que hem publicat a la revista Cell Reports es tracta d'un estudi metodològic que demostra la utilitat d'aquest sistema per a la detecció de drivers inductors del desenvolupament del càncer, però també té importància clínica, ja que existeix un inhibidor de FGF3 aprovat als Estats Units per a càncer de bufeta i biliar i aquest estudi obre la porta a investigar si seria eficaç una teràpia adreçada a FGF3 en pacients amb càncer d'esòfag, que sol ser de mal pronòstic” conclou el Dr. José Antonio Seoane.

La investigació que realitza el Grup de Biologia Computacional del Càncer del VHIO, liderat pel Dr. José Antonio Seoane compta amb el suport de la Fundació “la Caixa”.

L'estudi ha desenvolupat una tecnologia capaç d'identificar alteracions en el nombre de còpies genètiques inductors de la tumorogènesi.

Share it:

Notícies relacionades

Related activities

Curso Prematuridad: Debate, casos prácticos y demostración en directo

11/19/2024 - 08:45
Obstetricia i ginecología
More information

Curso Cir y Preeclampsia: Actualización y casos prácticos

11/20/2024 - 08:45
Obstetricia y ginecología
More information

III Curso Impacto de las nuevas Tecnologías en el Control de la Diabetes

11/27/2024 - 15:00
Profesionales sanitarios de Atención Primaria del Área Sanitaria del Hospital Vall d'Hebron y endocrinólogos de otros centros con especial interés en tecnologías en diabetes y su transferencia a la atención primaria.
More information

V Curso nacional de rehabilitación en las deformidades del Raquis

Sala de actos planta 0, Hospital de Traumatología Hospital Vall d´Hebron Pg. de la Vall d´Hebron, 119, 08035 Barcelona
11/28/2024 - 09:00
Especialistas en Medicina Física y Rehabilitación, Cirugía ortopédica y Traumatología, Fisioterapeutas, y Técnicos superiores de Ortesis y Prótesis.
More information

Subscribe to our newsletters and be a part of Campus Life

By accepting these conditions, you are agreeing to the processing of your personal data for the provision of the services requested through this portal, and, if necessary, for any procedures required by the administrations or public bodies involved in this processing, and their subsequent inclusion in the aforementioned automated file. You may exercise your rights to access, rectification, cancellation or opposition by writing to web@vallhebron.cat, clearly stating the subject as "Exercising of Data Protection Rights".
Operated by: Hospital Universitari Vall d'Hebron - Institut Català de la Salut.
Purpose: Manage the user’s contact information.
Legitimisation: Express acceptance of the privacy policy.
Rights: To access, rectify, and delete personal information data, as well to the portability thereof and to limit and/or oppose their use.
Source: The interested party themselves.